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科學(xué)家測(cè)序動(dòng)物界最大基因組

2024年08月16日08:25 | 來源:科技日?qǐng)?bào)
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原標(biāo)題:科學(xué)家測(cè)序動(dòng)物界最大基因組

據(jù)最新一期《自然》雜志報(bào)道,德國(guó)康斯坦茨大學(xué)和維爾茨堡大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì),對(duì)動(dòng)物界最大基因組的擁有者——肺魚進(jìn)行了基因組測(cè)序。肺魚基因組約為人類基因組大小的30倍。測(cè)序數(shù)據(jù)有望揭示當(dāng)今陸地脊椎動(dòng)物的魚類祖先如何成功登陸的奧秘。

泥盆紀(jì)時(shí)期(約4.2億至3.6億年前),一種具有強(qiáng)健胸鰭和肺的肉鰭魚類成功從淺水區(qū)域登陸,並能在海岸線上移動(dòng)和呼吸,這與現(xiàn)今的陸地脊椎動(dòng)物相似。這一事件標(biāo)志著脊椎動(dòng)物首次在陸地上移動(dòng),是進(jìn)化史上的重要裡程碑。所有后續(xù)的陸地脊椎動(dòng)物,包括兩棲動(dòng)物、爬行動(dòng)物、鳥類和哺乳動(dòng)物(包括人類),都可追溯至這一魚類祖先。然而,肉鰭魚類為何如此適應(yīng)陸地環(huán)境仍是未解之謎。

為了找到答案,研究人員分析了泥盆紀(jì)祖先的現(xiàn)存最近親屬的遺傳物質(zhì)。這些最近親屬中,隻有3個(gè)譜系的肺魚至今仍存活,分別在非洲、南美洲和澳大利亞。這些古老的“活化石”看起來仍然非常像它們的祖先。

研究人員對(duì)這3種譜系的肺魚基因組進(jìn)行了完整測(cè)序。結(jié)果顯示,南美洲肺魚的遺傳物質(zhì)在規(guī)模上打破了所有紀(jì)錄:其DNA超過900億個(gè)鹼基,是已知最大的動(dòng)物基因組,其大小是之前紀(jì)錄保持者——澳大利亞肺魚基因組的兩倍多。

康斯坦茨大學(xué)進(jìn)化生物學(xué)家阿克塞爾·邁耶說,南美洲肺魚的19條染色體中,有18條的大小均超過了擁有近30億個(gè)鹼基的人類基因組。隨著時(shí)間推移,自主轉(zhuǎn)座子是肺魚基因組膨脹到如此巨大的原因。這些DNA序列會(huì)“復(fù)制”,然后改變它們?cè)诨蚪M中的位置,進(jìn)而導(dǎo)致基因組的增長(zhǎng)。

分析表明,南美洲肺魚基因組的擴(kuò)張速度是目前有記錄以來最快的。在過去的每1000萬年裡,其基因組都會(huì)增長(zhǎng),增長(zhǎng)的量相當(dāng)於整個(gè)人類基因組的大小。而且它還在繼續(xù)增長(zhǎng),有証據(jù)表明造成這一現(xiàn)象的轉(zhuǎn)座子仍處於活躍狀態(tài)。

研究人員確定了這一巨大基因組增長(zhǎng)的機(jī)制,極端擴(kuò)張的部分原因在於piRNA豐度極低。這種RNA通常會(huì)使轉(zhuǎn)座子沉默。

研究還發(fā)現(xiàn),肺魚鰭的進(jìn)化與Shh信號(hào)通路的變化有關(guān),這一發(fā)現(xiàn)為硬骨魚的輻鰭與陸地脊椎動(dòng)物手指之間的進(jìn)化聯(lián)系提供了額外証據(jù),並有望揭示脊椎動(dòng)物是如何從海洋登上陸地的。

(記者張佳欣)

(責(zé)編:郝孟佳、李昉)

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