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構(gòu)建人工智能框架 找到最有效溶菌酶

2024年09月04日08:31 | 來(lái)源:科技日?qǐng)?bào)
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原標(biāo)題:構(gòu)建人工智能框架 找到最有效溶菌酶

記者9月2日獲悉,廣東工業(yè)大學(xué)生物醫(yī)藥學(xué)院教授林章凜團(tuán)隊(duì)與華南理工大學(xué)生物學(xué)院副教授楊曉鋒團(tuán)隊(duì)合作,成功構(gòu)建出一種新型的人工智能框架——DeepMineLys,並借此框架發(fā)現(xiàn)了迄今為止在人類(lèi)微生物組中最有效的溶菌酶。近日,該研究成果發(fā)表於《細(xì)胞報(bào)告》。

“該研究利用人工智能,從人類(lèi)微生物宏基因組數(shù)據(jù)中識(shí)別和挖掘出有治療耐藥菌潛力的溶菌酶,這是人工智能用於生物學(xué)研究領(lǐng)域的一個(gè)重要突破。”論文第一作者、華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院2018級(jí)博士生付一然說(shuō)。

林章凜認(rèn)為,DeepMineLys的成功得益於構(gòu)建了涵蓋廣泛溶菌酶的全面訓(xùn)練數(shù)據(jù)集,集成了TAPE等先進(jìn)算法和編碼技術(shù),採(cǎi)用了三層卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和雙軌架構(gòu)等幾個(gè)關(guān)鍵因素,極大地提升了預(yù)測(cè)性能。

研究團(tuán)隊(duì)從前100個(gè)候選溶菌酶隨機(jī)選擇了16個(gè)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)証,其中11個(gè)被証實(shí)具有活性,最強(qiáng)的一個(gè)溶菌酶的活性甚至比傳統(tǒng)溶菌酶高出6.2倍,成為迄今為止在人類(lèi)微生物組中發(fā)現(xiàn)的最有效的溶菌酶?!癉eepMineLys不僅能夠挖掘溶菌酶,還具備挖掘蛋白質(zhì)的潛力。由此可見(jiàn),該框架的構(gòu)建為未來(lái)生物學(xué)研究提供了一個(gè)有力的工具?!绷终聞C說(shuō)。

(記者葉青)

(責(zé)編:郝孟佳、李昉)

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